Открытый доступ Открытый доступ  Закрытый доступ Доступ платный или только для подписчиков

Идентификация штаммов автохтонной микрофлоры – основы биопрепаратов лечебно-профилактического действия

татьяна маратовна шуваева

Аннотация


С помощью метода количественной ПЦР в реальном времени проведён сравнительный дифференциальный анализ распределения представителей автохтонной микрофлоры в различных отделах желудочно-кишечного тракта японского перепела (Coturnix japonica). Проведены культурально-морфологические исследования смешанных культур и индивидуальных клонов видо-ассоциированных микроорганизмов. Получены чистые культуры наиболее представленных штаммов родов  LactobacillusBifidobacterium и Bacillus. По данным  анализа нуклеотидной последовательности гена 16S рРНК отобранные штаммы отнесены к видам L. agilis, L. salivarius, L. intermedius, Bifidobacterium sp., Bacillus sp., B. subtilis и B.megaterium. Методами молекулярного типирования выявлены внутривидовые генетические отличия семи  выделенных штаммов бактерий. На основе идентифицированных и естественных для данного вида эволюционно-закреплённых микробных ассоциаций предложены подходы  для оптимизации состава существующих и создания новых отечественных высокоэффективных пробиотиков.


Ключевые слова


микрофлора, ПЦР в реальном времени, идентификация штаммов, молекулярное типирование, 16S рРНК, пробиотики

Ссылки


Neef A., Sanz Y./Curr. Opin. Clin. Nutr. Metab. Care. 2013.V. 16. P. 679-687.

Su H., McKelvey J., Rollins D., Zhang M., Brightsmith D. J., Derr J., Zhang S. /PLoS ONE. 2014. V.9. N 6. P. e99826.

Bermudez-Brito M., Plaza-Dнaz J., Muсoz-Quezada S.,Gуmez-Llorente C., Gil A. /Ann. Nutr. Metab. 2012. V. 61. P. 160–174.

Stanley D., Hughes R. J., Moore R. J. /Appl Microbiol Biotechnol. 2014. V. 98. P. 4301–4310.

Han W., Zhang X. L., Wang D. W., Li L. Y., Liu G. L., Li A. K., Zhao Y. X. /J. Anim. Sci. 2013. V. 91. P. 4374–4382.

Oakley B. B., Lillehoj H. S., Kogut M. H., Kim W. K., Maurer J. J., Pedroso A., Lee M.D., Collett S. R., Johnson T. J., Cox N. A. /FEMS Microbiol. Lett. 2014. V. 360. P. 100–112.

Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование /М.: Изд. Мир. 1984. 479 С.

Lunedo R., Fernandez-Alarcon M. F., Carvalho F. M. S., Furlan L. R., Macari M. // British Poultry Science. 2014. V. 55. № 6. P. 795–803.

Han W., Zhang X. L., Wang D. W., Li L. Y., Liu G. L., Li A. K., Zhao Y. X. / J. Anim. Sci. 2013. V. 91. P. 4374–4382.

Lane D. // 16S/23S sequencing. Nucleic Acid Techniques in Bacterial Systematics / Ed. Stackebrandt E., Goodfellow M. Chichester.: John Wiley & Sons, Ltd., 1991. P. 115–175.

Svec P., Pantucek R., Petras P., Sedlacek I., Novakova D. //Systematic. Appl. Microbiology. 2010. V. 33. P. 451–456.

Dorneles E.M.S., Santana J.A., Ribeiro D., Dorella F.A., Guimaraes A.S., Moawad M.S., Selim S.A., Garaldi A.L.M., Miyoshi A., Ribeiro M.G., Gouveia A.M.G., Azevedo V., Heinemann M.B.,Lage A.P./PLoS ONE. 2014. V. 9. N 6. e98758.

Guindon S.1., Delsuc F., Dufayard J.F., Gascuel O./ Methods Mol Biol. 2009.V.537. P.113-37.

Ребриков Д.В., Саматов Г.А., Трофимов Д.Ю., Семенов П.А., Савилова А.М., Кофиади И.А., Абрамов Д.Д.//ПЦР в реальном времени. Из-во БИНОМ.2009. 215с.

Messaoudi S., Manai M., Kergourlay G., Pr?vost H., Connil N., Chobert J.M., Dousset X. /Food Microbiol. 2013. V. 36. N 2. P. 296-304.

Lee C.M., Sieo C.C., Cheah Y.K., Abdullah N., Ho Y.W. //J. Sci. Food. Agric. 2012. V. 92. N 3. P. 660-666.

Ramirez-Castrill?n M., Mendes S.D., Inostroza-Ponta M., Valente P. //PLoS ONE. 2014. V. 29. № 9(8). P. e105870.

Bottacini F., Ventura M., Sinderen D., Motherway M. /Microb. Cell. Factories. 2014. Suppl. 1. S4.

Kharchenko N.V., Cherdyntseva T.A., Netrusov A.I./ Mikrobiologiia. 2015. V. 84. N 3. P. 352–359.

Lu J., Santo Domingo J.W., Hill S., Edge T.A. / Appl. Environ. Microbiol. 2009. V. 75. N 18. P. 5919-5926.

Scupham A.J., Patton T.G., Bent E., Bayles D.O. /Microb. Ecol. 2008. V. 56. N 2. P. 322-331.

Khochamit N., Siripornadulsil S., Sukon P., Siripornadulsil W. /Microbiol. Res. 2015. V. 170. P. 36–50.

Bagherzadeh Kasmani F., Karimi Torshizi M. A., Allameh A., Shariatmadari F. / Poult. Sci. 2012. V. 91. N 8. P. 1846-53.

Shivaramaiah S., Pumford N. R., Morgan M. J., Wolfenden R. E., Wolfenden A. D., Torres-Rodriguez A., Hargis B. M., Tellez. G. /Poult. Sci. 2011. V. 90. P. 1574–1580.


Полный текст: PDF

Ссылки

  • Ссылки не определены.


** ** ** ** ** **

ISSN: 2073-8099

** ** ** ** ** **

Подписаться на наши издания Вы можете через почтовые каталоги Объединенный каталог «Пресса России» «Урал Пресс», «Ивис»«Прессинформ» и «Профиздат».

 

Наши партнеры:

iIPhEB - Международная выставка и форум по фармацевтике и биотехнологиям, 2–4 апреля 2024

Семинар R&D для R&D, 12–13 апреля 2024