Открытый доступ
Доступ платный или только для подписчиков
Исследование биотрансформации индивидуальных авермектинов
Аннотация
Разработана математическая модель, которая позволяет провести достоверный прогноз биотрансформации природных и полусинтетических авермектинов, а также выявить структурные фрагменты молекул, наиболее влияющие на проявление данного свойства. Основой для построения модели послужила структурно разнородная выборка, представленная органическим соединением с экспериментальными значениями периода полубиотрансформации. Для оценки предсказательной способности выборка была разделена на обучающий (405 соединений) и тестовый (136 соединений) наборы. С использованием интернет-платформы «OCHEM», в которой реализован расчет PyDescriptor и метод случайного леса, построена удовлетворительная ( = 0,76) модель количественной связи «структура – активность», находящаяся в свободном доступе. Расчёты показали, что биотрансформация природных авермектинов в рыбах происходит в среднем в 3 раза быстрее, чем полусинтетических, при этом определены структурные фрагменты, которые повышают и понижают скорость биотрансформации. Проведена структурная интерпретация предложенной QSAR модели, в ходе которой определены часто встречающиеся молекулярные трансформации, повышающие и понижающие скорость биотрансформации органических соединений в рыбах. Для сравнительного анализа использована QSAR модель, интегрированная в экспертную систему Агентства по охране окружающей среды США.
DOI: 10.30906/2073-8099-2022-14-3-9-18
Ключевые слова
Ссылки
Shoop W. L., Mrozik H., Michael, Fisher M. H. / Vet. Parasitol. 1995. V. 59. No 2. P. 139 – 156.
Zhuo Y., Zhang T., Wang Qi, Cruz-Morales P., Zhang B., Liu M., Barona-G?mez F., Zhang L. / Biotechnol. J. 2014. V. 9. P. 316 – 325.
Crump A., Omura S. / Proc. Jpn. Acad. Ser. B, Phys. Biol. Sci. 2011. V. 87. No. 2. P. 13 – 28.
https://www.nobelprize.org/prizes/medicine.
Prichard R., M?nez C., Lespine A. / Int. J. Parasitol. Drugs Drug Resist. 2012. V. 2. P. 134 – 153/
Мосин В. А., Кругляк Е. Б., Стерлина Т. С., Корыстов Ю. Н., Шапошникова В. В., Кублик Л. Н., Левитман М. Х., Викторов А. В., Дриняев В. А. / Антибиот. и химиотер. 1999. Т. 44. № 6. С. 16 – 20.
Дриняев В. А., Мосин В. А., Кругляк Е. Б., Стерлина Т. С., Новик Т. С., Ермакова Н. В., Кублик Л. Н., Левитман М. Х., Шапошникова В. В., Корыстов Ю. Н. / Антибиот. и химиотер. 2004. Т. 49. № 6. С. 3 – 5.
Wagstaff K. M., Sivakumaran H., Heaton S. M., Harrich D., Jans D. A. / Biochem. J. 2012. V. 443 P. 851 – 856. DOI: 10.1042/BJ20120150.
Mansouri K., Ringsted T., Ballabio D., Todeschini R., Consonni V. / J. Chem. Inf. Model. 2013. V. 53. P. 867 – 878. DOI: 10.1021/ci4000213.
Bai S. H., Ogbourne S. / Chemosphere. 2016. V. 154. P. 204 – 214. DOI: 10.1016/j.chemosphere.2016.03.113.
Cherkasov A., Muratov E. N., Fourches D., Varnek A., Baskin I., Cronin M., Dearden J., Gramatica P., Martin Y. C., Todeschini R., Consonni V., Kuz’min V. E., Cramer R., Benigni R., Yang C., Rathman J., Terfloth L., Gasteiger J., Richard A., Tropsha A. / J. Med. Chem. 2014. V. 57. No. 12. P. 4977 – 5010. DOI: 10.1021/jm4004285.
Arnot J. A., Meylan W., Tunkel J., Howard P., Mackay D., Bonnell M., Boethling R. S. / Environ. Toxicol. Chem. 2009. V. 28. P. 1168 – 1177.
Papa E., van der Wal L., Arnot J. A., Gramatica P. / Sci. Total Environ. 2014. V. 470 – 471. P. 1040 – 1046.
Mansouri K., Grulke C. M., Judson R. S., Williams A. J. / J. Cheminform. 2018. V. 10. P. 1 – 19.
https://www.epa.gov/tsca-screening-tools/epi-suitetm- estimation-program-interface.
https://comptox.epa.gov/dashboard.
Jaworska J., Nikolova-Jeliazkova N., Aldenberg T. / Altern. Lab. Anim. 2005. V. 33. No. 5. P. 445 – 459.
Mansouri K., Grulke C. M., Richard A. M., Judson R. S., Williams A. J. / SAR QSAR Environ. Res. 2016. V. 27. No. 11. P. 939 – 965.
Fourches D., Muratov E., Tropsha A. / J. Chem. Inf. Model. 2010. V. 50. No. 7. P. 1189 – 1204.
Arnot J. A., Mackay D., Bonnell M. / Environ. Toxicol. Chem. 2008. V. 27. P. 341 – 351.
https://ochem.eu.
Masand V. H., Rastija V. / Chemometr. Intell. Lab. Systems. 2017. V. 169. P. 12 – 18.
Breiman L. / Machine Learning. 2001. V. 45. P. 5 – 32.
http://docs.ochem.eu/display/MAN/ OCHEM+Introduction.
Sushko Y., Novotarskyi S., Korner R., Vogt J., Abdelaziz, A., Tetko I. / J. Cheminf. 2014. V. 6. P. 48.
Вергейчик Т. Х. Токсикологическая химия. — М.: МЕДпресс-информ, 2012. — 432 с.
Helbling D. E., Hollender J., Kohler H. PE, Fenner K. / Environ. Sci. Technol. 2010. V. 44. No. 17. P. 6628 – 6635.
Ссылки
- Ссылки не определены.
** ** ** ** ** **
ISSN: 2073-8099
** ** ** ** ** **
Подписаться на наши издания Вы можете через почтовые каталоги Объединенный каталог «Пресса России» «Урал Пресс», «Ивис», «Прессинформ» и «Профиздат».
Наши партнеры:
iIPhEB - Международная выставка и форум по фармацевтике и биотехнологиям, 2–4 апреля 2024